Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms