Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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PtprnQ60673 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PtprnQ60673 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PtprnQ60673 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PtprnQ60673 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PtprnQ60673 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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PtprnQ60673 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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PtprnQ60673 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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PtprnQ60673 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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PtprnQ60673 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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PtprnQ60673 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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PtprnQ60673 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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PtprnQ60673 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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