Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms