Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms