Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms