Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam71bQ5STT6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms