Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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