Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r223Q5SSA0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r223Q5SSA0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms