Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps54Q5SPW0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms