Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps41Q5KU39 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms