Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH62

Xkr9, XK-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xkr9Q5GH62 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xkr9Q5GH62 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms