Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm3Q5F4S9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms