Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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