Protein–RNA interactions for Protein: Q571E5

Prss53, Serine protease 53, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss53Q571E5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prss53Q571E5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms