Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms