Protein–RNA interactions for Protein: Q3V185

BC147527, Similar to 2-cell-stage, variable group, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC147527Q3V185 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC147527Q3V185 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC147527Q3V185 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms