Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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D130052B06RikQ3UW13 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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D130052B06RikQ3UW13 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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D130052B06RikQ3UW13 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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D130052B06RikQ3UW13 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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D130052B06RikQ3UW13 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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D130052B06RikQ3UW13 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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D130052B06RikQ3UW13 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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D130052B06RikQ3UW13 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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D130052B06RikQ3UW13 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D130052B06RikQ3UW13 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
D130052B06RikQ3UW13 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
D130052B06RikQ3UW13 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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