Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnga4Q3UW12 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga4Q3UW12 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms