Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nr1d1Q3UV55 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr1d1Q3UV55 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms