Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms