Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms