Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc1Q3UPH1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms