Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rmi2Q3UPE3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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