Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam83fQ3UKU4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms