Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ceacam5Q3UKK2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ceacam5Q3UKK2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ceacam5Q3UKK2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ceacam5Q3UKK2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ceacam5Q3UKK2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms