Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph3aQ3UFY4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms