Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf180Q3U827 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf180Q3U827 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
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