Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U595 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U595 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U595 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U595 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U595 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U595 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U595 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U595 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U595 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U595 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U595 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U595 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U595 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U595 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U595 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U595 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U595 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U595 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U595 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U595 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U595 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U595 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U595 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U595 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U595 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U595 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U595 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U595 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U595 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U595 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U595 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U595 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U595 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U595 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U595 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U595 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U595 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U595 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U595 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U595 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U595 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U595 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U595 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U595 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U595 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U595 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U595 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3U595 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U595 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U595 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U595 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U595 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U595 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U595 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3U595 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U595 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U595 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U595 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U595 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U595 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U595 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U595 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U595 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U595 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U595 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U595 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U595 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U595 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U595 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U595 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3U595 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U595 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U595 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U595 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U595 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U595 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U595 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U595 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U595 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U595 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U595 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U595 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U595 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U595 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U595 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U595 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U595 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U595 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3U595 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U595 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U595 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U595 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U595 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U595 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U595 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U595 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U595 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U595 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3U595 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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