Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gse1Q3U3C9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms