Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d2bQ3U0J8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbc1d2bQ3U0J8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbc1d2bQ3U0J8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbc1d2bQ3U0J8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbc1d2bQ3U0J8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbc1d2bQ3U0J8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbc1d2bQ3U0J8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d2bQ3U0J8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d2bQ3U0J8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d2bQ3U0J8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d2bQ3U0J8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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