Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hace1Q3U0D9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms