Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
InipQ3TXT3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms