Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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