Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ccdc136Q3TVA9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms