Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem104Q3TB48 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem104Q3TB48 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms