Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prr27Q3SYJ2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr27Q3SYJ2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms