Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc2Q3SXD3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hddc2Q3SXD3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms