Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccbe1Q3MI99 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms