Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim71Q1PSW8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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