Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo3bQ1EG27 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo3bQ1EG27 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo3bQ1EG27 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo3bQ1EG27 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo3bQ1EG27 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo3bQ1EG27 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo3bQ1EG27 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo3bQ1EG27 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo3bQ1EG27 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo3bQ1EG27 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo3bQ1EG27 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo3bQ1EG27 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo3bQ1EG27 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo3bQ1EG27 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo3bQ1EG27 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo3bQ1EG27 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo3bQ1EG27 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Myo3bQ1EG27 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Myo3bQ1EG27 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Myo3bQ1EG27 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myo3bQ1EG27 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo3bQ1EG27 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo3bQ1EG27 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo3bQ1EG27 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo3bQ1EG27 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo3bQ1EG27 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo3bQ1EG27 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo3bQ1EG27 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo3bQ1EG27 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo3bQ1EG27 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo3bQ1EG27 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo3bQ1EG27 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo3bQ1EG27 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms