Protein–RNA interactions for Protein: Q14A28

Prok1, Prokineticin-1, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prok1Q14A28 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prok1Q14A28 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prok1Q14A28 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prok1Q14A28 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prok1Q14A28 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms