Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpusd2Q149F1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpusd2Q149F1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms