Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VgfQ0VGU4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms