Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms