Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Neurl1bQ0MW30 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms