Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2bQ0KL01 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubxn2bQ0KL01 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms