Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms