Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms