Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnma1Q08460 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnma1Q08460 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms