Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gata4Q08369 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.6 ms